Los corazones de estas chicas jóvenes son puros, y también violentos. Mato Kuroi entró en el instituto, y en el primer día, alguien le tapa los ojos: su compañera Yomi Takanashi. Las dos se conocen. La inocente e ingenua Mato. La madura Yomi. Parecen muy diferentes, pero el tiempo que pasan juntas sólo fortalece una amistad cada vez mayor. Pero cuando entran en su segundo año de instituto, las colocan en diferentes clases, y ellas empiezan a distanciarse. Pero en algún lugar simultáneamente... En otro mundo, una chica joven, con fuego azul en sus ojos, Black Rock Shooter se enfrenta a otra chica; ésta sujeta una guadaña negra, Dead Master, y una batalla a muerte empieza a desarrollarse.
