La historia trata sobre un semi-hikikomori llamado Takumi Nishijo de 15 años recidente de Shibuya que se ve rodeado de incidentes tales como homicidios, suicidios colectivos, etc, eventos que son enmarcados dentro de lo que se denomina "New Generation" o Nueva generación. Con extraños mensages llegados a su computadora a través de el chat de un juego MMORPG llamado Empire Sweeper (llamado también Universo EMS), donde es conocido con el nickname de Knight Heart el más grandioso de los jugadores, en donde otro de los jugadores, en primera parte uno con sobrenombre "Shogun" le muestra algunas imagenes de los incidentes de la "New Generation" incluso antes que estos ocurran. De esta manera Takumi se ve involucrado en la causa origen y solución de los eventos. Durante el transcurso de la serie Takumi sufre trastornos psíquicos como perdidas de memoria y neurosis.
