Tras un año del fracaso de la Rebelión Negra, en el area 11 se aplican sentencias más severas de parte del Imperio, que está en graves tensiones contra EEUU y la Federación China, que vez trata de conquistar el Área 11 sin guerra. Mientras, Lelouch tiene una vida normal como estudiante y ha olvidado su pasado como Zero, hasta el día en que se ve envuelto en un altercado y se reencuentra con la misteriosa mujer C.C. quien le revela su propósito olvidado. Destruyendo a sus enemigos y declarándose como Zero una vez más, Lelouch se dispone a terminar lo que empezó.
