Se trata de la segunda adaptación al anime de Super Robot Wars, y está basado en Super Robot Taisen OG Episode 2: The Inspector, el videojuego RPG de la saga Super Robot Wars creada por Namco Bandai. 6 meses después de la conclusión de la Campaña L5 y la guerra DC, los equipos de los transportistas PT, Hagane y Hiryuu se han ido en caminos diferentes. Pero no estarán separados por mucho tiempo, sin embargo, cuando los remanentes de la DC comienzan su ataque contra las Fuerzas de la Federación con recursos recién adquiridos. Una organización misteriosa, la Shadow Mirror, ha comenzado a armarlos con armas y robots que no deberían existir.
